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根据测算，杨某在综合计算工时周期内的确存在超过总法定标准工作时间的情况，因此，仲裁委按150％的标准支持了杨某主张的部分加班工资。双方均认可裁决结果，已产生法律效力。

《工资支付暂行规定》第十三条规定

因此，执行综合计算工时工作制，并不等于不需要支付加班工资。企业应该合理安排时间，否则仍需要支付劳动者因超时工作的加班费。

A公司已申请并通过了执行综合计算工时工作制的审批，执行综合工作工时制的岗位含杨某的岗位，因此杨某在工作期间是否加班，应按照其综合计算工作时间的周期（年）统计总工作时间并对比相应周期内的法定标准工作时间。对于超过部分，企业应按照不低于劳动合同规定的小时工资标准的150％支付杨某加班工资。

当然，如用人单位在法定休假日安排工作的，无论总工时是否超过法定标准工作时长，都应支付300％的加班工资。

综合工时制是针对企业生产特点、工作性质或职责范围的需求，无法适用标准工时制，或需要机动作业的职工而采用的一种特殊的工时制度。企业要采用这种工时制度，应当注意以下几点：执行不定时工时制必须经过当地人社部门审批；企业必须与执行综合工时制相关岗位的劳动者有明确约定；虽然执行综合工时制，在具体某一工作日内不受加班时间限制，但企业在安排工作时仍必须按照相关法律法规规定保障劳动者的休息权和身心健康。